ترکیب اعضای هیات امنای موسسه عبارتند از:
1- وزیر جهاد کشاورزی (رئیس هیات امناء)
2- وزیر علوم، تحقیقات و فناوری یا نماینده وی
3- رئیس سازمان مدیریت و برنامه ریزی کشور یا نماینده وی
4- سه تا پنج تن از شخصیت های علمی – فرهنگی که نقش موثری در توسعه و پیشرفت موسسه داشته باشند.
5- رئیس موسسه ( دبیر هیات امناء)